El Programa Género, Ambiente y Desarrollo, busca, a través de mecanismos de participación en las Políticas Públicas Ambientales orientadas al Desarrollo Sustentable, incorporar y fortalecer la perspectiva de género en las acciones de la SAyDS, procurando estrategias de transversalidad en todos los planes de trabajo y en los procesos de toma de decisiones para cumplir y dar seguimiento a los acuerdos nacionales, regionales e internacionales.
Entre sus acciones se propone propiciar la formación, la capacitación ciudadana y la participación de las Organizaciones de la Sociedad Civil en materia de Ambiente, Género y Desarrollo Sustentable.